南通市海门区政府办公室设下列内设机构：
（一）综合股
（二）调研股
（三）秘书一股
（四）秘书二股
（五）秘书三股
（六）秘书四股
（七）秘书五股
（八）区政府督查室
（九）外事股
（十）法制和政务公开股
（十一）金融发展协调服务股
（十二）金融监管和风险防控处置股
